Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPROQ16827 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPROQ16827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPROQ16827 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPROQ16827 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms