Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FOXD1Q16676 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
FOXD1Q16676 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXD1Q16676 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXD1Q16676 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
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