Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TBR1Q16650 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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