Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL23Q16540 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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