Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRY1Q16526 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRY1Q16526 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRY1Q16526 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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