Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCAPHQ15003 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCAPHQ15003 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCAPHQ15003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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