Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NWD1Q149M9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NWD1Q149M9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NWD1Q149M9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NWD1Q149M9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
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