Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHD4Q14839 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHD4Q14839 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHD4Q14839 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
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