Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM29Q14134 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM29Q14134 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM29Q14134 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms