Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG2Q14126 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG2Q14126 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms