Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE7AQ13946 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE7AQ13946 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE7AQ13946 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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