Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms