Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCIRG1Q13488 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TCIRG1Q13488 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TCIRG1Q13488 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCIRG1Q13488 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
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