Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXE3Q13461 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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