Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
PDE3BQ13370 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE3BQ13370 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE3BQ13370 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE3BQ13370 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
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