Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PAPPAQ13219 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PAPPAQ13219 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PAPPAQ13219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PAPPAQ13219 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
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