Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PRDM2Q13029 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM2Q13029 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM2Q13029 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
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