Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK3Q13003 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK3Q13003 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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