Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SEPT1-210ENST00000573615 1616 ntTSL 519.74■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 SEPT1-205ENST00000566517 1080 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 SEPT1-204ENST00000563957 2738 ntTSL 515.24■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.259e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.329e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.339e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.42e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.531e-7■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 34.88□□□□□ -1.632e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 54.68□□□□□ -1.662e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.914e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 324.56■■□□□ 1.524e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 315.52■□□□□ 0.084e-8■■■■□ 26.3
ILF3Q12906 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 222.75■■□□□ 1.234e-7■■■■□ 26.2
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ILF3Q12906 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.354e-7■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-7■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.346e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 NMNAT1-203ENST00000462686 1818 ntTSL 515.89■□□□□ 0.136e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RINT1-206ENST00000493041 563 ntTSL 515.21■□□□□ 0.036e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.186e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RINT1-202ENST00000467392 837 ntTSL 313.77□□□□□ -0.216e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AGO2-203ENST00000518019 421 ntTSL 213.48□□□□□ -0.256e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.496e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.586e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.76e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RINT1-208ENST00000497979 2627 ntTSL 510.35□□□□□ -0.756e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 NMNAT1-202ENST00000403197 1094 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.776e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 RINT1-207ENST00000493258 497 ntTSL 29.71□□□□□ -0.866e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 NMNAT1-201ENST00000377205 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.986e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 NMNAT1-204ENST00000492735 514 ntTSL 37.04□□□□□ -1.286e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AGO2-202ENST00000517293 422 ntTSL 36.44□□□□□ -1.386e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.536e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 SNAP29-202ENST00000439214 681 ntTSL 35.24□□□□□ -1.576e-8■■■■□ 26.2
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ILF3Q12906 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.611e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)4.3□□□□□ -1.721e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.796e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.811e-8■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-9■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PCGF5-202ENST00000490164 973 ntTSL 216.35■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-6■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 59.46□□□□□ -0.97e-9■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 49.38□□□□□ -0.917e-9■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 27.79□□□□□ -1.167e-9■■■■□ 26.2
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ILF3Q12906 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 47.36□□□□□ -1.237e-9■■■■□ 26.2
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ILF3Q12906 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.3□□□□□ -2.047e-9■■■■□ 26.2
ILF3Q12906 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 XRCC6-203ENST00000402580 2006 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 XRCC6-204ENST00000405506 1958 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.893e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-211ENST00000589425 1944 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.653e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-209ENST00000588169 1700 ntTSL 218.63■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-212ENST00000589426 2033 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-210ENST00000588281 1776 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 PGS1-207ENST00000586880 431 ntTSL 314.57□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 38.56□□□□□ -1.043e-26■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-26■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.443e-26■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.98□□□□□ -1.453e-26■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-218ENST00000527118 700 ntTSL 315.55■□□□□ 0.084e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-205ENST00000445722 580 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-215ENST00000524393 583 ntTSL 312.57□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-203ENST00000401893 762 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-217ENST00000526193 568 ntTSL 48.52□□□□□ -1.054e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 RBBP4-211ENST00000477563 544 ntTSL 57.62□□□□□ -1.194e-8■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 215.62■□□□□ 0.094e-14■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-14■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.554e-14■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-14■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.174e-14■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.484e-7■■■■□ 26.1
ILF3Q12906 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 26.1
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