Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX4Q12846 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX4Q12846 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX4Q12846 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX4Q12846 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX4Q12846 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX4Q12846 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX4Q12846 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX4Q12846 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX4Q12846 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX4Q12846 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX4Q12846 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX4Q12846 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX4Q12846 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX4Q12846 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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