Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMPCAQ10713 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMPCAQ10713 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMPCAQ10713 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMPCAQ10713 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMPCAQ10713 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMPCAQ10713 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms