Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q0VFX4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q0VFX4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q0VFX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q0VFX4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q0VFX4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q0VFX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q0VFX4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q0VFX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q0VFX4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q0VFX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q0VFX4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q0VFX4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q0VFX4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q0VFX4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q0VFX4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q0VFX4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q0VFX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q0VFX4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q0VFX4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q0VFX4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q0VFX4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q0VFX4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q0VFX4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q0VFX4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms