Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SPIRE1Q08AE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPIRE1Q08AE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPIRE1Q08AE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms