Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LOXL1Q08397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LOXL1Q08397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms