Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX9Q08211 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DHX9Q08211 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms