Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXM1Q08050 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXM1Q08050 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms