Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LRP1Q07954 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRP1Q07954 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms