Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TFF3Q07654 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFF3Q07654 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms