Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 HRP1YOL123W 1605 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 LYS5YGL154C 819 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 THI4YGR144W 981 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 CKB2YOR039W 777 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 ULA1YPL003W 1389 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 PIF1YML061C 2580 nt7.6□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 TAF10YDR167W 621 nt7.59□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 HIR1YBL008W 2523 nt7.59□□□□□ -1.19
GDB1Q06625 ARN1YHL040C 1884 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 FAU1YER183C 636 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 ATM1YMR301C 2073 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 YDR514CYDR514C 1452 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 TRP5YGL026C 2124 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 MCH4YOL119C 1506 nt7.58□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 YDR541CYDR541C 1035 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 UBA3YPR066W 900 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 MRL1YPR079W 1146 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 BUD8YLR353W 1812 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 CCR4YAL021C 2514 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 PEP4YPL154C 1218 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 NOT3YIL038C 2511 nt7.57□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 SSK1YLR006C 2139 nt7.56□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 DIT2YDR402C 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 GWT1YJL091C 1473 nt7.56□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 ARG8YOL140W 1272 nt7.56□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 TIF5YPR041W 1218 nt7.56□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 VTS1YOR359W 1572 nt7.55□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 MND2YIR025W 1107 nt7.55□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 AVT4YNL101W 2142 nt7.55□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 ASH1YKL185W 1767 nt7.54□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 YLR317WYLR317W 435 nt7.54□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 SRV2YNL138W 1581 nt7.54□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 RPT4YOR259C 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 YNG2YHR090C 849 nt7.53□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 YOL131WYOL131W 327 nt7.53□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 PRP31YGR091W 1485 nt7.53□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 VPS5YOR069W 2028 nt7.53□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 SLC1YDL052C 912 nt7.52□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 BIM1YER016W 1035 nt7.52□□□□□ -1.2
GDB1Q06625 QRI1YDL103C 1434 nt7.52□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 RPL21BYPL079W 483 nt7.52□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 AVT3YKL146W 2079 nt7.52□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 YPT32YGL210W 669 nt7.51□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 AVO1YOL078W 3531 nt7.51□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 CLB1YGR108W 1416 nt7.5□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 IDP1YDL066W 1287 nt7.5□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 PEX22YAL055W 543 nt7.5□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 GAL10YBR019C 2100 nt7.5□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 YDR053WYDR053W 396 nt7.49□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 SER33YIL074C 1410 nt7.49□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt7.48□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 ERG4YGL012W 1422 nt7.48□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 GPM3YOL056W 912 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 YLF2YHL014C 1218 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 APN1YKL114C 1104 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 CCS1YMR038C 750 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 CUE5YOR042W 1236 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 DCI1YOR180C 816 nt7.47□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 CEF1YMR213W 1773 nt7.46□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 SAF1YBR280C 1914 nt7.46□□□□□ -1.21
GDB1Q06625 UTP18YJL069C 1785 nt7.46□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 ERG12YMR208W 1332 nt7.46□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 YDL027CYDL027C 1263 nt7.46□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 PDH1YPR002W 1551 nt7.45□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 ADE4YMR300C 1533 nt7.45□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 NTE1YML059C 5040 nt7.45□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 VMA2YBR127C 1554 nt7.44□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 SCS2YER120W 735 nt7.44□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 YBL044WYBL044W 369 nt7.44□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 PSH1YOL054W 1221 nt7.44□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 KEX2YNL238W 2445 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 QDR1YIL120W 1692 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 PRS1YKL181W 1284 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 RRT2YBR246W 1164 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 GEX1YCL073C 1848 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 GEX2YKR106W 1848 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 PRP2YNR011C 2631 nt7.43□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 HXT3YDR345C 1704 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 SEC12YNR026C 1416 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 RPL7AYGL076C 735 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 RPL7BYPL198W 735 nt7.42□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 RAP1YNL216W 2484 nt7.41□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 NSG2YNL156C 900 nt7.41□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 YPR098CYPR098C 486 nt7.41□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 YFL042CYFL042C 2025 nt7.41□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 ACO1YLR304C 2337 nt7.4□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 LYS2YBR115C 4179 nt7.4□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 ENT5YDR153C 1236 nt7.4□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 PDB1YBR221C 1101 nt7.4□□□□□ -1.22
GDB1Q06625 ATG20YDL113C 1923 nt7.4□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 HSP31YDR533C 714 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 PUS6YGR169C 1215 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 RPS19BYNL302C 435 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 VMA13YPR036W 1437 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 HFI1YPL254W 1467 nt7.39□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 GEP5YLR091W 882 nt7.38□□□□□ -1.23
GDB1Q06625 MRPL39YML009C 213 nt7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.8 ms