Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD51Q06609 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD51Q06609 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD51Q06609 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD51Q06609 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms