Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNB3Q05901 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNB3Q05901 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms