Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD164Q04900 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CD164Q04900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CD164Q04900 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CD164Q04900 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CD164Q04900 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms