Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TAP1Q03518 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TAP1Q03518 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAP1Q03518 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAP1Q03518 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms