Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POU3F1Q03052 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU3F1Q03052 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms