Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4A11Q02928 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4A11Q02928 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4A11Q02928 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms