Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG1Q02413 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG1Q02413 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms