Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP27A1Q02318 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP27A1Q02318 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP27A1Q02318 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms