Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms