Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB1Q01826 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SATB1Q01826 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB1Q01826 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB1Q01826 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms