Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGCS1Q01581 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGCS1Q01581 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCS1Q01581 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms