Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DEFA6Q01524 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DEFA6Q01524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DEFA6Q01524 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms