Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMP22Q01453 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PMP22Q01453 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PMP22Q01453 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMP22Q01453 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMP22Q01453 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PMP22Q01453 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PMP22Q01453 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms