Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDLBPQ00341 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDLBPQ00341 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HDLBPQ00341 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDLBPQ00341 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms