Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKOR1P84550 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKOR1P84550 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms