Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPCAP84074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPCAP84074 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPCAP84074 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPCAP84074 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPCAP84074 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HPCAP84074 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPCAP84074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPCAP84074 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HPCAP84074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
HPCAP84074 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPCAP84074 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPCAP84074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPCAP84074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms