Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP2P81877 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSBP2P81877 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP2P81877 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms