Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT2P78371 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT2P78371 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT2P78371 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCT2P78371 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCT2P78371 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCT2P78371 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCT2P78371 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCT2P78371 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCT2P78371 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCT2P78371 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCT2P78371 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCT2P78371 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCT2P78371 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCT2P78371 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCT2P78371 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCT2P78371 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCT2P78371 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCT2P78371 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCT2P78371 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCT2P78371 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCT2P78371 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCT2P78371 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms