Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOMO3P69849 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NOMO3P69849 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOMO3P69849 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms