Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNC1P63316 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC1P63316 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNC1P63316 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms