Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERVK_113P63132 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms